Chromophoreกลุ่มของอะตอมและอิเล็กตรอนซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของโมเลกุลอินทรีย์ที่ทำให้เกิดสี
ความสัมพันธ์ระหว่างคุณสมบัติเชิงโครงสร้างของสารประกอบทางเคมีและสีของมันถูกแสวงหามาตั้งแต่ประมาณปี 1870 เมื่อมีการตั้งข้อสังเกตว่า quinones และสารประกอบอะโซเอโตและไนโตรอะโรมาติกมักมีสีสูงและสีจะลดลงหรือถูกทำลายเมื่อสารประกอบถูกเติมไฮโดรเจน ความสามารถของสารประกอบในการรับไฮโดรเจนที่เรียกว่า unsaturation เกิดจากการมีอิเล็กตรอนที่ไม่ถูกยึดติดแน่นในพันธะโควาเลนต์ระหว่างอะตอมของคู่ที่เฉพาะเจาะจง แต่ครอบครองพื้นที่ขนาดใหญ่ของโมเลกุล (orbitals) ซึ่งอาจเกี่ยวข้องกับอะตอมหลายอะตอม. อิเล็กตรอนเหล่านี้สามารถดูดซับพลังงานจากแสงในช่วงความยาวคลื่นในขอบเขตที่มองเห็นได้ การส่งผ่านหรือการสะท้อนของส่วนที่เหลือของแสงก่อให้เกิดสีที่สังเกตได้ของสารประกอบ ผลการย้อมสีลึกหากมีหลาย chromophores เข้าร่วมอย่างใกล้ชิดในโมเลกุลเดียวกันหรือหากมีกลุ่มอื่นที่เรียกว่า auxochrome
