ระบบอนุกรมวิธาน
อนุกรมวิธานวิทยาศาสตร์ของการจำแนกสิ่งมีชีวิตอยู่บนพื้นฐานของวิวัฒนาการ อนุกรมวิธานระบบก่อนไม่มีพื้นฐานทางทฤษฎี; สิ่งมีชีวิตถูกจัดกลุ่มตามความคล้ายคลึงกันที่ชัดเจน นับตั้งแต่การตีพิมพ์ในปี 2402 ของชาร์ลส์ดาร์วินบนต้นกำเนิดของสายพันธุ์โดยวิธีคัดเลือกโดยธรรมชาติอย่างไรก็ตามอนุกรมวิธานได้รับการยอมรับตามข้อเสนอที่ได้รับการยอมรับเกี่ยวกับวิวัฒนาการและความสัมพันธ์
ข้อมูลและข้อสรุปของสายเลือดแสดงให้เห็นอย่างชัดเจนว่าต้นไม้แห่งชีวิตเป็นผลผลิตของกระบวนการทางประวัติศาสตร์ของการวิวัฒนาการและองศาของความคล้ายคลึงภายในและระหว่างกลุ่มที่สอดคล้องกับองศาของความสัมพันธ์โดยการสืบเชื้อสายมาจากบรรพบุรุษร่วมกัน ไฟโตจีโนนีที่พัฒนาเต็มที่มีความจำเป็นสำหรับการจัดทำอนุกรมวิธานที่สะท้อนถึงความสัมพันธ์ตามธรรมชาติในโลกของสิ่งมีชีวิต
หลักฐานของสายเลือดเฉพาะ
นักชีววิทยาที่อ้างถึง phylogenies ได้รับหลักฐานที่มีประโยชน์มากที่สุดของพวกเขาจากด้านซากดึกดำบรรพ์กายวิภาคเปรียบเทียบเปรียบเทียบคัพภวิทยาตัวอ่อนและพันธุศาสตร์โมเลกุล การศึกษาโครงสร้างโมเลกุลของยีนและการกระจายทางภูมิศาสตร์ของพืชและสัตว์ก็มีประโยชน์เช่นกัน บันทึกซากดึกดำบรรพ์มักถูกนำมาใช้เพื่อกำหนดความเป็นสายเลือดของกลุ่มที่มีชิ้นส่วนร่างกายแข็ง มันยังใช้เพื่อนัดวันที่แตกต่างของสายพันธุ์ใน phylogenies ที่ได้รับการสร้างขึ้นบนพื้นฐานของหลักฐานระดับโมเลกุล
ข้อมูลส่วนใหญ่ที่ใช้ในการตัดสินใจทางวิวัฒนาการมาจากกายวิภาคเชิงเปรียบเทียบและจากคัพภแม้ว่าจะมีการค้นพบอย่างรวดเร็วโดยระบบที่สร้างขึ้นโดยใช้ข้อมูลระดับโมเลกุล ในการเปรียบเทียบคุณสมบัติทั่วไปของสปีชีส์ต่างกันนักกายวิภาคศาสตร์พยายามแยกแยะความแตกต่างระหว่าง homologies หรือความคล้ายคลึงที่สืบทอดมาจากบรรพบุรุษร่วมและ analogies หรือความคล้ายคลึงกันที่เกิดขึ้นในการตอบสนองต่อนิสัยและสภาพความเป็นอยู่ที่คล้ายคลึงกัน
การตรวจสอบทางชีวเคมีดำเนินการในช่วงครึ่งหลังของ 20 และต้นศตวรรษที่ 21 มีส่วนช่วยให้ข้อมูลที่มีค่าในการศึกษาสายวิวัฒนาการ โดยการนับความแตกต่างในลำดับของหน่วยที่ประกอบขึ้นเป็นโมเลกุลของโปรตีนและกรดเด็อกซีบอนนิวคลีอิก (DNA) นักวิจัยได้คิดค้นเครื่องมือสำหรับการวัดระดับของสิ่งมีชีวิตที่แตกต่างกันตั้งแต่วิวัฒนาการมาจากบรรพบุรุษร่วมกัน เนื่องจากไมโตคอนเดรียดีเอ็นเอมีอัตราการกลายพันธุ์ที่สูงมากเมื่อเทียบกับดีเอ็นเอนิวเคลียร์มันมีประโยชน์สำหรับการสร้างความสัมพันธ์ระหว่างกลุ่มที่มีการเบี่ยงเบนไปเมื่อเร็ว ๆ นี้ โดยพื้นฐานแล้วการประยุกต์ใช้พันธุศาสตร์ระดับโมเลกุลกับระบบเชิงกลมีความคล้ายคลึงกับการใช้ไอโซโทปรังสีในการออกเดททางธรณีวิทยา: การเปลี่ยนแปลงของโมเลกุลในอัตราที่แตกต่างกันกับบางอย่างเช่นไมโทคอนเดรียดีเอ็นเอวิวัฒนาการอย่างรวดเร็วและอื่น ๆ ข้อสันนิษฐานที่สำคัญในการใช้โมเลกุลในการสร้างสายไฟใหม่คือการเลือกยีนที่เหมาะสมสำหรับอายุของอนุกรมวิธานภายใต้การศึกษา
