การพัฒนาวัคซีน
ในช่วงต้นทศวรรษที่ 1870 ปาสเตอร์ได้รับชื่อเสียงและความเคารพอย่างสูงในฝรั่งเศสและในปี 1873 เขาได้รับเลือกเป็นสมาชิกสมทบของAcadémie de Médecine อย่างไรก็ตามสถานประกอบการทางการแพทย์ก็ไม่เต็มใจที่จะยอมรับทฤษฎีเชื้อโรคของเขาเพราะส่วนใหญ่มาจากนักเคมี อย่างไรก็ตามในช่วงทศวรรษหน้าปาสเตอร์พัฒนาหลักการโดยรวมของการฉีดวัคซีนและมีส่วนทำให้รากฐานของภูมิคุ้มกันวิทยา
การค้นพบครั้งสำคัญครั้งแรกของปาสเตอร์ในการศึกษาการฉีดวัคซีนเกิดขึ้นในปี พ.ศ. 2422 และเกี่ยวข้องกับโรคที่เรียกว่าอหิวาตกโรคไก่ (วันนี้แบคทีเรียที่ก่อให้เกิดโรคนั้นจัดอยู่ในสกุลปาสเตอร์เรลล่า) ปาสเตอร์กล่าวว่า“ โอกาสเพียงช่วยสนับสนุนจิตใจที่เตรียมไว้” และเป็นโอกาสสังเกตซึ่งเขาค้นพบว่าวัฒนธรรมของอหิวาตกโรคไก่สูญเสียเชื้อโรคและเก็บรักษาไว้ ลักษณะที่ทำให้เกิดโรคในช่วงหลายชั่วอายุคน เขาฉีดวัคซีนไก่ด้วยแบบลดทอนและแสดงให้เห็นว่าไก่มีความต้านทานต่อสายพันธุ์ที่รุนแรงอย่างเต็มที่ จากนั้นเป็นต้นมาปาสเตอร์นำงานทดลองทั้งหมดของเขาไปสู่ปัญหาการสร้างภูมิต้านทานและประยุกต์ใช้หลักการนี้กับโรคอื่น ๆ อีกมากมาย
ปาสเตอร์เริ่มสอบสวนโรคแอนแทรกซ์ในปี พ.ศ. 2422 ในเวลานั้นการระบาดของโรคแอนแทรกซ์ในฝรั่งเศสและในส่วนอื่น ๆ ของยุโรปได้ฆ่าแกะเป็นจำนวนมากและโรคก็โจมตีมนุษย์เช่นกัน แพทย์ชาวเยอรมัน Robert Koch ประกาศแยกเชื้อแอนแทรกซ์บาซิลลัสซึ่งปาสเตอร์ยืนยัน Koch และ Pasteur ให้อิสระกับหลักฐานการทดลองที่ชัดเจนว่าเชื้อแบคทีเรียชนิดนี้มีหน้าที่รับผิดชอบต่อการติดเชื้อ สิ่งนี้ได้สร้างทฤษฎีเกี่ยวกับเชื้อโรคขึ้นมาอย่างมั่นคงซึ่งเป็นแนวคิดพื้นฐานที่เกี่ยวข้องกับจุลชีววิทยาทางการแพทย์
ปาสเตอร์ต้องการใช้หลักการฉีดวัคซีนกับโรคแอนแทรกซ์ เขาเตรียมวัฒนธรรมที่ลดทอนลงของบาซิลลัสหลังจากกำหนดเงื่อนไขที่นำไปสู่การสูญเสียความรุนแรงของสิ่งมีชีวิต ในฤดูใบไม้ผลิของปี 2424 เขาได้รับการสนับสนุนทางการเงินส่วนใหญ่มาจากเกษตรกรเพื่อทำการทดลองสร้างภูมิคุ้มกันโรคแอนแทรกซ์ในที่สาธารณะ การทดลองเกิดขึ้นที่ Pouilly-le-Fort ซึ่งตั้งอยู่ในเขตชานเมืองทางตอนใต้ของกรุงปารีส ปาสเตอร์สร้างภูมิคุ้มกันให้กับสัตว์เลี้ยงในฟาร์ม 70 ตัวและการทดลองก็ประสบความสำเร็จอย่างสมบูรณ์ ขั้นตอนการฉีดวัคซีนนั้นเกี่ยวข้องกับการฉีดวัคซีนสองครั้งเป็นระยะเวลา 12 วันกับวัคซีนที่มีความสามารถต่างกัน วัคซีนหนึ่งตัวจากวัฒนธรรมที่มีความรุนแรงต่ำให้แกะครึ่งตัวและตามด้วยวัคซีนตัวที่สองจากวัฒนธรรมที่รุนแรงกว่าครั้งแรก สองสัปดาห์หลังจากการฉีดวัคซีนครั้งแรกเหล่านี้ทั้งการฉีดวัคซีนและการควบคุมแกะถูกฉีดวัคซีนด้วยโรคแอนแทรกซ์ ภายในไม่กี่วันฝูงแกะที่ตายแล้วก็รอดชีวิตมาได้ในขณะที่สัตว์ที่ได้รับวัคซีนทั้งหมดรอดชีวิตมาได้ สิ่งนี้ทำให้หลายคนเชื่อว่างานของปาสเตอร์นั้นใช้ได้จริง
หลังจากความสำเร็จของการทดลองฉีดวัคซีนโรคแอนแทรกซ์ปาสเตอร์มุ่งเน้นไปที่ต้นกำเนิดของเชื้อจุลินทรีย์ การตรวจสอบสัตว์ที่ติดเชื้อจากจุลินทรีย์ที่ทำให้เกิดโรคและการศึกษากลไกของจุลินทรีย์ที่ทำให้เกิดผลกระทบทางสรีรวิทยาที่เป็นอันตรายในสัตว์ทำให้เขาเป็นผู้บุกเบิกด้านพยาธิวิทยาติดเชื้อ มีการกล่าวกันบ่อยครั้งว่า Edward Jenner ศัลยแพทย์ชาวอังกฤษค้นพบการฉีดวัคซีนและปาสเตอร์คิดค้นวัคซีน อันที่จริงเกือบ 90 ปีหลังจากเจนเนอร์เริ่มให้วัคซีนกับไข้ทรพิษปาสเตอร์ก็พัฒนาวัคซีนอีกตัวหนึ่งซึ่งเป็นวัคซีนตัวแรกที่ป้องกันโรคพิษสุนัขบ้า เขาตัดสินใจที่จะโจมตีปัญหาโรคพิษสุนัขบ้าในปี ค.ศ. 1882 ซึ่งเป็นปีที่เขายอมรับกับAcadémieFrançaise โรคพิษสุนัขบ้าเป็นโรคที่น่ากลัวและน่ากลัวที่จินตนาการอันโด่งดังมานานหลายศตวรรษเพราะต้นกำเนิดลึกลับและความกลัวที่เกิดขึ้น การพิชิตนั้นจะเป็นความพยายามครั้งสุดท้ายของปาสเตอร์
ปาสเตอร์สงสัยว่าเอเจนต์ที่ก่อให้เกิดโรคพิษสุนัขบ้าเป็นจุลินทรีย์ (ตัวแทนถูกค้นพบในภายหลังว่าเป็นไวรัสซึ่งเป็นเอนทิตีที่ไม่มีชีวิต) มันเล็กเกินกว่าที่จะเห็นได้ภายใต้กล้องจุลทรรศน์ของปาสเตอร์และจากการทดลองกับโรคจึงเรียกร้องให้มีการพัฒนาวิธีการใหม่ทั้งหมด ปาสเตอร์เลือกที่จะทำการทดลองของเขาโดยใช้กระต่ายและส่งตัวแทนการติดเชื้อจากสัตว์สู่สัตว์โดยการฉีดวัคซีน intracerebral จนกว่าเขาจะได้รับการเตรียมการที่มั่นคง เพื่อลดทอนตัวแทนที่มองไม่เห็นเขาจึงถอนสายกระดูกสันหลังของสัตว์ที่ติดเชื้อจนกระทั่งการเตรียมนั้นแทบจะไม่มีความเป็นพิษ เขาตระหนักในภายหลังว่าแทนที่จะสร้างตัวแทนแบบลดทอนการรักษาของเขาได้ทำให้เป็นกลางแล้ว (ปาสเตอร์รับรู้ถึงผลการทำให้เป็นกลางในฐานะที่เป็นเอฟเฟกต์การฆ่าเนื่องจากเขาสงสัยว่าเอเจนต์นั้นเป็นสิ่งมีชีวิต) ดังนั้นเขาจึงผลิตโดยไม่รู้ตัวแทนการลดเชื้อจุลินทรีย์ที่มีชีวิตเป็นเอเจนต์เป็นกลางและเปิดทางให้ การพัฒนาวัคซีนประเภทที่สองหรือที่เรียกว่าวัคซีนที่ไม่ใช้งาน
เมื่อวันที่ 6 กรกฎาคม พ.ศ. 2428 ปาสเตอร์ให้การฉีดวัคซีนโจเซฟมีสเตอร์เด็กชายอายุเก้าขวบซึ่งถูกสุนัขกัดบ้ากัด วัคซีนประสบความสำเร็จอย่างมากจนทำให้ชื่อเสียงและชื่อเสียงของปาสเตอร์เป็นจริง เหยื่อผู้ถูกกัดอีกหลายร้อยคนทั่วโลกได้รับการช่วยชีวิตจากวัคซีนของปาสเตอร์และยุคของยาป้องกันได้เริ่มขึ้น แคมเปญระดมทุนระหว่างประเทศได้เปิดตัวเพื่อสร้างสถาบันปาสเตอร์ในปารีสการริเริ่มดังกล่าวเกิดขึ้นเมื่อวันที่ 14 พฤศจิกายน พ.ศ. 2431
